萍乡市卫生健康委员会（简称市卫健委）是市政府组成部门，为正县级单位。
市卫健委机关设有办公室、组织人事科、体制改革与规划信息科、财务审计科、政务服务科（政策法规科）、疾病预防控制与爱卫科、医政医管科、基层卫生健康科、卫生应急与药政食品监测科（突发公共卫生事件应急指挥中心）、科技教育科、综合监督科、老龄健康科（保健科）、妇幼健康科、人口监测与家庭发展科、职业健康科、宣传科、中医药科17个职能科室和机关党委。现有编制数50个，其中行政编45个，工勤编5个。实有人员46人，其中正县级3人、副县级8人、四级调研员4人、正科级16人、副科级6人、科员5人、工勤人员2人、新招录公务员2人（暂未上编）。市直卫生健康单位15个，职工4500余人。